Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UPP1Q16831 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UPP1Q16831 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms