Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LAMA3Q16787 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
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