Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ACKR1Q16570 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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