Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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GABRA6Q16445 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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GABRA6Q16445 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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GABRA6Q16445 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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GABRA6Q16445 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
GABRA6Q16445 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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