Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SSX1Q16384 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SSX1Q16384 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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SSX1Q16384 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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SSX1Q16384 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SSX1Q16384 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SSX1Q16384 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SSX1Q16384 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SSX1Q16384 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SSX1Q16384 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SSX1Q16384 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SSX1Q16384 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SSX1Q16384 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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SSX1Q16384 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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SSX1Q16384 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSX1Q16384 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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