Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNHIT3Q15649 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms