Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
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PUM3Q15397 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
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PUM3Q15397 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
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PUM3Q15397 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PUM3Q15397 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PUM3Q15397 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
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