Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UBE3CQ15386 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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UBE3CQ15386 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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UBE3CQ15386 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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UBE3CQ15386 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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UBE3CQ15386 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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UBE3CQ15386 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBE3CQ15386 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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