Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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RABEP1Q15276 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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RABEP1Q15276 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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RABEP1Q15276 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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RABEP1Q15276 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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RABEP1Q15276 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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RABEP1Q15276 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RABEP1Q15276 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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RABEP1Q15276 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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RABEP1Q15276 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RABEP1Q15276 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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