Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRKQ15262 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
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