Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PCOLCEQ15113 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms