Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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BRD3Q15059 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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BRD3Q15059 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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BRD3Q15059 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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BRD3Q15059 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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BRD3Q15059 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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BRD3Q15059 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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BRD3Q15059 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
BRD3Q15059 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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