Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
POLD3Q15054 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms