Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TNIP1Q15025 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TNIP1Q15025 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms