Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LAPTM4AQ15012 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LAPTM4AQ15012 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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LAPTM4AQ15012 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LAPTM4AQ15012 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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LAPTM4AQ15012 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LAPTM4AQ15012 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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