Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SMC1AQ14683 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMC1AQ14683 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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