Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNGB1Q14028 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNGB1Q14028 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
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