Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EXOSC2Q13868 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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