Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DUSP4Q13115 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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