Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NFX1Q12986 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NFX1Q12986 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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