Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BNIP1Q12981 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BNIP1Q12981 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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