Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TROQ12816 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TROQ12816 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TROQ12816 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TROQ12816 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TROQ12816 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TROQ12816 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TROQ12816 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TROQ12816 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TROQ12816 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TROQ12816 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TROQ12816 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TROQ12816 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TROQ12816 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TROQ12816 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TROQ12816 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TROQ12816 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TROQ12816 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TROQ12816 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TROQ12816 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TROQ12816 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TROQ12816 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TROQ12816 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TROQ12816 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TROQ12816 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TROQ12816 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TROQ12816 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TROQ12816 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TROQ12816 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TROQ12816 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TROQ12816 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TROQ12816 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TROQ12816 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TROQ12816 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TROQ12816 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TROQ12816 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
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