Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DSC1Q08554 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms