Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CACNG1Q06432 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms