Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PLCB3Q01970 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms