Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CACNA1BQ00975 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms