Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP1Q00587 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms