Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDK3Q00526 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDK3Q00526 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms