Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2BQ00403 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms