Protein–RNA interactions for Protein: Q00013

MPP1, 55 kDa erythrocyte membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP1Q00013 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MPP1Q00013 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MPP1Q00013 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MPP1Q00013 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MPP1Q00013 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MPP1Q00013 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MPP1Q00013 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MPP1Q00013 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MPP1Q00013 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MPP1Q00013 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MPP1Q00013 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MPP1Q00013 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MPP1Q00013 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MPP1Q00013 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MPP1Q00013 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MPP1Q00013 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MPP1Q00013 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MPP1Q00013 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MPP1Q00013 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MPP1Q00013 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MPP1Q00013 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MPP1Q00013 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms