Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FGD1P98174 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FGD1P98174 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGD1P98174 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGD1P98174 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms