Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FAM3AP98173 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms