Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAE1P78406 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAE1P78406 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAE1P78406 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAE1P78406 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAE1P78406 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAE1P78406 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAE1P78406 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAE1P78406 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAE1P78406 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAE1P78406 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAE1P78406 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAE1P78406 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAE1P78406 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAE1P78406 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAE1P78406 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAE1P78406 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAE1P78406 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAE1P78406 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAE1P78406 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAE1P78406 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAE1P78406 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAE1P78406 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAE1P78406 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAE1P78406 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms