Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
POLR2FP61218 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
POLR2FP61218 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms