Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLRP6P59044 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms