Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN8P56748 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN8P56748 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms