Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
POLR2KP53803 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms