Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SLC5A3P53794 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SLC5A3P53794 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.1 ms