Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPAP49450 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPAP49450 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPAP49450 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPAP49450 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPAP49450 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPAP49450 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPAP49450 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPAP49450 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms