Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD2P49005 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLD2P49005 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLD2P49005 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLD2P49005 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD2P49005 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD2P49005 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD2P49005 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD2P49005 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD2P49005 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD2P49005 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD2P49005 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD2P49005 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD2P49005 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD2P49005 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD2P49005 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD2P49005 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD2P49005 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD2P49005 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD2P49005 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD2P49005 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLD2P49005 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms