Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAPZBP47756 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms