Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MDH1P40925 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MDH1P40925 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
MDH1P40925 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
MDH1P40925 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MDH1P40925 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms