Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FDFT1P37268 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FDFT1P37268 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms