Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.03■□□□□ -0
THBS4P35443 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.02■□□□□ -0
THBS4P35443 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
THBS4P35443 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
THBS4P35443 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
THBS4P35443 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
THBS4P35443 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
THBS4P35443 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
THBS4P35443 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
THBS4P35443 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
THBS4P35443 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms