Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNNA1P35221 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms