Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCC1P33527 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCC1P33527 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms