Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TSPOP30536 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TSPOP30536 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TSPOP30536 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TSPOP30536 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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