Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CMPK1P30085 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms