Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms