Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSFA2P28290 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms